RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SNTG2Q9NY99 539 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD1Q9UP38 647 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LRCH4O75427 683 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LTFP02788 710 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ICAM1P05362 532 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT8P05787 483 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH4A1P30038 563 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP3P42574 277 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GABREP78334 506 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CRY1Q16526 586 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DHFR2Q86XF0 187 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LGI2Q8N0V4 545 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD4AQ8N468 514 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM150BA6NC51 233 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBBXA8MT70 800 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H423 210 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNKO75909 580 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK2O95069 426 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAP29O95721 258 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 F2P00734 622 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1B2P21281 511 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PROZP22891 400 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTFP26441 200 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPGP40121 348 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LIG4P49917 911 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FPGSQ05932 587 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL15Q16663 113 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BROXQ5VW32 411 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NEK5Q6P3R8 708 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SCML4Q8N228 414 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTD1Q8N815 330 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGED4Q96JG8 741 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 YME1L1Q96TA2 773 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CDYLQ9Y232 598 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM24O15164 1050 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 AXIN1O15169 862 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAN1A2O60476 641 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR37L1O60883 481 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DRAP01903 254 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT7P08729 469 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ITIH1P19827 911 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN10P78369 228 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGFQ07326 219 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP24A1Q07973 514 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CDONQ4KMG0 1287 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EMC1Q8N766 993 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 REPS2Q8NFH8 660 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF516Q92618 1163 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ELP3Q9H9T3 547 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PAK5Q9P286 719 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms