RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CARD9Q9H257 536 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP29Q9HBJ7 922 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD84Q9UIB8 345 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.45□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A0J9YYE9 177 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HACD1B0YJ81 288 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GIPC1O14908 333 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AURKAO14965 403 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF185O15231 689 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSPAN6O43657 245 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LIASO43766 372 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CEP104O60308 925 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDC3O75056 442 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP12O75317 370 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TJP3O95049 919 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRBC1P01850 177 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FGGP02679 453 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 THEGLP0DJG4 465 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GNSP15586 552 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD38P28907 300 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HNF1BP35680 557 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ETV3P41162 512 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WNT3AP56704 352 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LMNB2Q03252 620 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ELP6Q0PNE2 266 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPARCL1Q14515 664 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRM3Q14832 879 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDKN3Q16667 212 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HLA-BQ31612 363 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERAP2Q6P179 960 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IPMKQ8NFU5 416 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EID2BQ96D98 161 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COQ10AQ96MF6 247 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPATA13Q96N96 652 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FICDQ9BVA6 458 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR27Q9NS67 375 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.44□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FRYQ5TBA9 3013 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VILLO15195 856 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR39O43194 453 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TM7SF2O76062 418 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLDN7O95471 211 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 METTL18O95568 372 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOD1P00441 154 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AKT2P31751 481 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KCNJ1P48048 391 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STC1P52823 247 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPHB1P54762 984 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XRCC4Q13426 336 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEK5Q6P3R8 708 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTC27Q6P3X3 843 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM74Q86UV6 250 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBFAQ8N0V3 343 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CEP76Q8TAP6 659 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPOCK2Q92563 424 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CENPTQ96BT3 561 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUS1Q96E22 293 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FEM1CQ96JP0 617 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGAP2Q99490 1192 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GAREM1Q9H706 876 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AMACRQ9UHK6 382 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KLF15Q9UIH9 416 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms