RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 NRCAMQ92823 1304 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0A0MRY4 1105 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FUOMA2VDF0 154 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OGTO15294 1046 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SUSD5O60279 629 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINB7O75635 380 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB5O75953 348 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 VAPBO95292 243 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CTSBP07858 339 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MYL3P08590 195 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PDGFRAP16234 1089 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MYF6P23409 242 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CTGFP29279 349 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SDC4P31431 198 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ENTPD1P49961 510 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LIMK2P53671 638 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMBIM6P55061 237 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GJA9P57773 515 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NKX3-2P78367 333 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MPP1Q00013 466 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LZTR1Q8N653 840 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT8Q8WV74 236 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIB2Q92519 343 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NINJ1Q92982 152 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35B4Q969S0 331 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM143Q96AN5 459 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC2Q96KP1 924 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA13Q96N96 652 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RBBP8Q99708 897 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SNX15Q9NRS6 342 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OXSMQ9NWU1 459 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GABRQQ9UN88 632 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRJQ12913 1337 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM64BA6NI03 449 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AQP12BA6NM10 295 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALT4O60513 344 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 UGT1A9O60656 530 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MSCO60682 206 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 C22orf31O95567 290 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 IL10P22301 178 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 HALP42357 657 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CDKL1Q00532 357 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PFKPQ01813 784 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 MTM1Q13496 603 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 CEACAM7Q14002 265 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SQLEQ14534 574 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 UGP2Q16851 508 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF534Q76KX8 674 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 LILRA2Q8N149 483 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.23□□□□□ -1.25
CTPS1-201ENST00000372616 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.23□□□□□ -1.25
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