RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RHOQP17081 205 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CHPFQ8IZ52 775 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SFRP1Q8N474 314 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 NUAK2Q9H093 628 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD19C9JJ37 291 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KRT36O76013 467 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CYP3A5P20815 502 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 USP46P62068 366 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GPR156Q8NFN8 814 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MYO19Q96H55 970 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf50Q9BV19 199 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PLLPQ9Y342 182 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ELFN1P0C7U0 828 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 COX10Q12887 443 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 USP4Q13107 963 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HMG20AQ9NP66 347 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GPR25O00155 361 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TREHO43280 583 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 NR2F1P10589 423 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CRHR1P34998 444 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HIPK3Q9H422 1215 aa20.31■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RFXANKO14593 260 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 IGFBP4P22692 258 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 HNF4AP41235 474 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PTSQ03393 145 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GMPPBQ9Y5P6 360 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS12A0PJE2 317 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN1O60635 241 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 NDST3O95803 873 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00032P0C843 101 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CUZD1Q86UP6 607 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD11O43934 449 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 C21orf59P57076 290 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 AAGABQ6PD74 315 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf88Q6PI97 169 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PNPOQ9NVS9 261 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 COG5Q9UP83 839 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 C1RP00736 705 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA16P05015 189 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ANPEPP15144 967 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LAG3P18627 525 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CPT1BQ92523 772 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 VPS35Q96QK1 796 aa20.3■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A3O75751 556 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ADH1CP00326 375 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1A4Q13733 1029 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 PMF1Q6P1K2 205 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ITCHQ96J02 903 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR52E6Q96RD3 313 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 VPS4AQ9UN37 437 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CXCR3P49682 368 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A3P53794 718 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 Q96MT0 163 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 TGDSO95455 350 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SELPP16109 830 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 CCNA2P20248 432 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 ADSSP30520 456 aa20.29■□□□□ 0.84
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A2P52569 658 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms