RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SLC4A1P02730 911 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 FCARP24071 287 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CCNFP41002 786 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 BMPR2Q13873 1038 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 VPS45Q9NRW7 570 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 NFKBIAP25963 317 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 TMPRSS15P98073 1019 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CBLBQ13191 982 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CNGA3Q16281 694 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RETSATQ6NUM9 610 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PARM1Q6UWI2 310 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 VITQ6UXI7 678 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM135Q86UB9 458 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF366Q8N895 744 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 LZICQ8WZA0 190 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RMDN1Q96DB5 314 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.38■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 AURKAO14965 403 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 TIMM44O43615 452 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SPAG7O75391 227 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PRLP01236 227 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PRKCHP24723 683 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 STX2P32856 288 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SERPINB4P48594 390 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 DMPKQ09013 629 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RCN1Q15293 331 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 STEAP4Q687X5 459 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CES5AQ6NT32 575 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC6Q86X45 466 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 UCMAQ8WVF2 138 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 FGF14Q92915 247 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 POMKQ9H5K3 350 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CDH7Q9ULB5 785 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SOBPA7XYQ1 873 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PIGNO95427 931 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ATP6V1C1P21283 382 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SEMG2Q02383 582 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 GSTM4Q03013 218 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 TRAF2Q12933 501 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRD1Q6QNK2 874 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CIPCQ9C0C6 399 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SOX13Q9UN79 622 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ARL5AQ9Y689 179 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.37■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 VAPBO95292 243 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 INHBAP08476 426 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ADH5P11766 374 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SRCP12931 536 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PCID2Q5JVF3 399 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 RNF43Q68DV7 783 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CCNJLQ8IV13 435 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ACDQ96AP0 544 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 VCANP13611 3396 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 FAM159BA6NKW6 160 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 MROH9Q5TGP6 573 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 MGARPQ8TDB4 240 aa16.36■□□□□ 0.21
CHTF18-202ENST00000317063 CERS2Q96G23 380 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms