RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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KCNS3-201ENST00000304101 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 HDAC10Q969S8 669 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 IFT43Q96FT9 208 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 POMKQ9H5K3 350 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 GPAMQ9HCL2 828 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.59■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 ATP6V1C1P21283 382 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 SERPINB5P36952 375 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 PBX2P40425 430 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 KCNQ1P51787 676 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 CUL3Q13618 768 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS3-201ENST00000304101 KLC3Q6P597 504 aa20.58■□□□□ 0.89
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KCNS3-201ENST00000304101 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.58■□□□□ 0.89
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KCNS3-201ENST00000304101 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.58■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC126Q96EE4 140 aa20.58■□□□□ 0.88
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KCNS3-201ENST00000304101 FGF1P05230 155 aa20.57■□□□□ 0.88
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KCNS3-201ENST00000304101 BTKQ06187 659 aa20.57■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 LAMB3Q13751 1172 aa20.57■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.57■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.57■□□□□ 0.88
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KCNS3-201ENST00000304101 SZT2Q5T011 3432 aa20.57■□□□□ 0.88
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KCNS3-201ENST00000304101 MUSKO15146 869 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 GJB3O75712 270 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 EPOP01588 193 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC166P0CW27 439 aa20.56■□□□□ 0.88
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KCNS3-201ENST00000304101 C5orf22Q49AR2 442 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 RNF135Q8IUD6 432 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 TTC16Q8NEE8 873 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 SLC22A2O15244 555 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 ACSL4O60488 711 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 RBP1P09455 135 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 THRAP10827 490 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 EPHB1P54762 984 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PEX6Q13608 980 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 KDM1BQ8NB78 822 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 C2orf78A6NCI8 922 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 NEMP2A6NFY4 417 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 FKBP6O75344 327 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 ZMPSTE24O75844 475 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 S1PR4O95977 384 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PIK3R1P27986 724 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PFKPQ01813 784 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 ACVR1Q04771 509 aa20.55■□□□□ 0.88
KCNS3-201ENST00000304101 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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