RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 TIFAQ96CG3 184 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 MFSD3Q96ES6 412 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 C2P06681 752 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CNPP09543 421 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PRKG2Q13237 762 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 VITQ6UXI7 678 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TRIM69Q86WT6 500 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 GPR135Q8IZ08 494 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PROX1Q92786 737 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 KLHL32Q96NJ5 620 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ATAD3AQ9NVI7 634 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CLUHO75153 1309 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ZMPSTE24O75844 475 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 OTCP00480 354 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 HSMCR30P0CW71 290 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 IDSP22304 550 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 LRPAP1P30533 357 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 SLC9A5Q14940 896 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TRIB2Q92519 343 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TWNKQ96RR1 684 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TMEM245Q9H330 911 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 RHOJQ9H4E5 214 aa10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 A0A1W2PPM1 405 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF1O95521 474 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ME2P23368 584 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 GNA13Q14344 377 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DLG2Q15700 870 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 MAPKAPK3Q16644 382 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 FAM187BQ17R55 369 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 C17orf64Q86WR6 236 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ERVW-1Q9UQF0 538 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 KNL1Q8NG31 2342 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ENPP3O14638 875 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CHRNB2P17787 502 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CCNCP24863 283 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 EPHA3P29320 983 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 GDI1P31150 447 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 GPD2P43304 727 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 SLC11A1P49279 550 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 IL5RAQ01344 420 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TPGS2Q68CL5 300 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ZNF567Q8N184 647 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ZNF366Q8N895 744 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DNAJB14Q8TBM8 379 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 STARD8Q92502 1023 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 MECRQ9BV79 373 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ATG10Q9H0Y0 220 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CCSER2Q9H7U1 834 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ACSS2Q9NR19 701 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 RGS5O15539 181 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 HCRTO43612 131 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 HS6ST1O60243 411 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 TCF3P15923 654 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 SPAM1P38567 509 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 GATMP50440 423 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 LBX1P52954 281 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 COPZ1P61923 177 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 KRT73Q86Y46 540 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 KLHL23Q8NBE8 558 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 SUSD3Q96L08 255 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 FBXW11Q9UKB1 542 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 URADA6NGE7 173 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 LRRC72A6NJI9 287 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 INSIG1O15503 277 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 LINC00032P0C843 101 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 PSMC3P17980 439 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CA9Q16790 459 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 KLHL35Q6PF15 583 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 CFAP206Q8IYR0 622 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 POMGNT2Q8NAT1 580 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 FBXO30Q8TB52 745 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 DCLRE1BQ9H816 532 aa10.68□□□□□ -0.7
TMX3-201ENST00000299608 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms