RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Aldh3a1P47739 453 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp6v0d1P51863 351 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AdprhP54923 362 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zhx1P70121 873 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxd13P70217 339 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uhmk1P97343 419 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Thumpd3P97770 505 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rcn1Q05186 325 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Calb2Q08331 271 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B3gntl1Q3U129 357 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnfaip2Q61333 691 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif2b4Q61749 524 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nrg1Q6DR99 700 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr17Q6NS65 339 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl29Q80T74 875 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TdrkhQ80VL1 560 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ItchQ8C863 864 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q8CC96 669 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cwf19l1Q8CI33 537 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GrpQ8R1I2 146 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AslQ91YI0 464 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cldnd1Q9CQX5 253 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CabyrQ9D424 453 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prss23Q9D6X6 382 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nsmce1Q9D720 266 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RalbQ9JIW9 206 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cngb3Q9JJZ9 694 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mpp6Q9JLB0 553 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grb14Q9JLM9 538 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B9d1Q9R1S0 204 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Asb4Q9WV71 426 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DnpepQ9Z2W0 473 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col12a1Q60847 3120 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcsk5Q04592 1877 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AspmQ8CJ27 3122 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl41A2AUC9 606 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2j12G3UXT0 502 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6408J3QNG1 320 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3402K7N5P2 326 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r5K7N788 911 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Socs5O54928 536 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prkag1O54950 330 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ldb2O55203 373 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stx7O70439 261 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pknox1O70477 436 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pias1O88907 651 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01740 135 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxa4P06798 285 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LifP09056 203 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prdx3P20108 257 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxa2P31245 372 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif5aP33175 1027 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Upp1P52624 311 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AdslP54822 484 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smpdl3bP58242 456 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abce1P61222 599 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rps24P62849 133 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IdsQ08890 552 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt80Q0VBK2 452 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2c65Q148B1 490 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam47cQ14BE7 430 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pgap2Q3TQR0 254 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ceacam5Q3UKK2 947 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb16Q3UQ17 673 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Drc1Q3USS3 753 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znrf3Q5SSZ7 913 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr464Q5SW48 313 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rabl6Q5U3K5 725 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgap30Q640N3 1101 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TCAIMQ66JZ4 499 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lemd2Q6DVA0 511 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AtminQ6P9S1 818 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abhd10Q6PE15 297 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dclk2Q6PGN3 756 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp595Q8BIN6 625 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PdhxQ8BKZ9 501 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Morc4Q8BMD7 928 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cers6Q8C172 384 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr60Q8C761 999 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adprhl2Q8CG72 370 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhl2Q8JZP3 593 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abcf3Q8K268 709 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slf1Q8R3P9 1054 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AjubaQ91XC0 547 aa9.28□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdha6Q91Y14 946 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.9 ms