RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc16a8O35308 492 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Hsd17b7O88736 334 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Arl6O88848 186 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CkbQ04447 381 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 IdsQ08890 552 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 GiprQ0P543 460 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam129aQ3UW53 926 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttf1Q62187 859 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tgoln1Q62313 353 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r218Q8R261 298 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 HlcsQ920N2 722 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tor1aQ9ER39 333 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pard6gQ9JK84 382 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cfap74Q3UY96 1578 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PrlP06879 226 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ntf3P20181 258 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nos3P70313 1202 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aldh1a2Q62148 518 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nae1Q8VBW6 534 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trappc5Q9CQA1 188 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mss51Q9D5Z5 446 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nek7Q9ES74 302 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r25W4VSP2 855 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tbc1d25A1A5B6 742 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rasa2P58069 847 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Timm8bP62077 83 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PtnP63089 168 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pdcd4Q61823 469 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tlr12Q6QNU9 906 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Msantd1Q8BIL2 278 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Bdh2Q8JZV9 245 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem203Q8R235 136 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mgrn1Q9D074 532 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acbd7Q9D258 88 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Btbd19S4R1I0 287 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm3893E9Q1I1 302 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 BpgmP15327 259 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdh5P55284 784 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zbtb14Q08376 449 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc9b2Q5BKR2 547 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc30a1Q60738 503 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Angptl1Q640P2 490 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc9a4Q8BUE1 797 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pbld1Q9DCG6 288 aa11.14□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tcf3P15806 651 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc2a9Q3T9X0 538 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Phactr4Q501J7 694 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nr2e1Q64104 385 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ssx9Q6XAS3 170 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zbtb24Q80X44 710 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ubp1Q811S7 540 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 KyQ8C8H8 661 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nr3c2Q8VII8 978 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gemin6Q9CX53 166 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Med11Q9D8C6 117 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cog8Q9JJA2 640 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cd97Q9Z0M6 818 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mettl1Q9Z120 268 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rasgef1aA0A0N4SVR5 498 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 CercamA3KGW5 592 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Glyatl3E9Q5L8 290 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm3033M0QWI0 180 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Irf8P23611 424 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stfa2P35174 103 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cntn3Q07409 1028 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Senp5Q6NXL6 749 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NanogQ80Z64 305 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mcoln2Q8K595 566 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lpin3Q99PI4 848 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cst11Q9D269 139 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prg3Q9JL95 222 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr2Q9QWU6 327 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pramef17A2ASJ1 475 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Myl4P09541 193 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pip5k1bP70181 539 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rit2P70425 217 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Txnl4aP83877 142 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam83hQ148V8 1209 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PomkQ3TUA9 349 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ldoc1Q7TPY9 151 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gabbr2Q80T41 940 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tspan8Q8R3G9 235 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fbxo21Q8VDH1 627 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Klhl1Q9JI74 751 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ptpn22P29352 802 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nat1P50294 290 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pdcd5P56812 126 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Syt16Q7TN83 639 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prkaa2Q8BRK8 552 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vps26bQ8C0E2 336 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nudt13Q8JZU0 352 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms