Protein–RNA interactions for Protein: P35174

Stfa2, Stefin-2, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa2P35174 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Stfa2P35174 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Stfa2P35174 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Stfa2P35174 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Stfa2P35174 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Stfa2P35174 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Stfa2P35174 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Stfa2P35174 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Stfa2P35174 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Stfa2P35174 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Stfa2P35174 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Stfa2P35174 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Stfa2P35174 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Stfa2P35174 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Stfa2P35174 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Stfa2P35174 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Stfa2P35174 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Stfa2P35174 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Stfa2P35174 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Stfa2P35174 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Stfa2P35174 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Stfa2P35174 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Stfa2P35174 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Stfa2P35174 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Stfa2P35174 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Stfa2P35174 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Stfa2P35174 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Stfa2P35174 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Stfa2P35174 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Stfa2P35174 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Stfa2P35174 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Stfa2P35174 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Stfa2P35174 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Stfa2P35174 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Stfa2P35174 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Stfa2P35174 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Stfa2P35174 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Stfa2P35174 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Stfa2P35174 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Stfa2P35174 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Stfa2P35174 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Stfa2P35174 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Stfa2P35174 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Stfa2P35174 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Stfa2P35174 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Stfa2P35174 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Stfa2P35174 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
Stfa2P35174 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Stfa2P35174 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Stfa2P35174 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Stfa2P35174 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Stfa2P35174 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Stfa2P35174 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Stfa2P35174 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Stfa2P35174 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Stfa2P35174 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Stfa2P35174 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Stfa2P35174 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Stfa2P35174 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Stfa2P35174 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Stfa2P35174 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Stfa2P35174 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Stfa2P35174 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Stfa2P35174 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Stfa2P35174 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Stfa2P35174 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Stfa2P35174 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Stfa2P35174 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Stfa2P35174 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Stfa2P35174 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Stfa2P35174 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Stfa2P35174 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Stfa2P35174 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Stfa2P35174 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Stfa2P35174 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Stfa2P35174 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Stfa2P35174 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Stfa2P35174 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Stfa2P35174 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Stfa2P35174 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Stfa2P35174 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
Stfa2P35174 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Stfa2P35174 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Stfa2P35174 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Stfa2P35174 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Stfa2P35174 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Stfa2P35174 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Stfa2P35174 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Stfa2P35174 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Stfa2P35174 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Stfa2P35174 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Stfa2P35174 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Stfa2P35174 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Stfa2P35174 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Stfa2P35174 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Stfa2P35174 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Stfa2P35174 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Stfa2P35174 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Stfa2P35174 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Stfa2P35174 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms