RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 BDNFP23560 247 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ARL2P36404 184 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 IST1P53990 364 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ITKQ08881 620 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LRP8Q14114 963 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HERC3Q15034 1050 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 STEAP4Q687X5 459 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CEP97Q8IW35 865 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZFP90Q8TF47 636 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CDT1Q9H211 546 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ALG9Q9H6U8 611 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 AKT3Q9Y243 479 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 U3KQV3 271 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GPR25O00155 361 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DFFAO00273 331 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CCL22O00626 93 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SNPHO15079 494 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ARPC2O15144 300 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SULT1C4O75897 302 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RGS20O76081 388 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LINC00032P0C843 101 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 KCNA5P22460 613 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DCKP27707 260 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GABRB3P28472 473 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 BAG6P46379 1132 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RAB15P59190 212 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TPI1P60174 286 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RAB10P61026 200 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 COPZ1P61923 177 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NAB1Q13506 487 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 STXBP2Q15833 593 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MEP1AQ16819 746 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PLD3Q8IV08 490 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MICU2Q8IYU8 434 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ANKFN1Q8N957 763 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 KLQ9UEF7 1012 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 VPS28Q9UK41 221 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 USP22Q9UPT9 525 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CSADQ9Y600 493 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.7□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TBX1O43435 398 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ASNA1O43681 348 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TBC1D4O60343 1298 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SEC24AO95486 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 BMP2P12643 396 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CXCR3P49682 368 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PLA2G16P53816 162 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HMGCS2P54868 508 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SNX16P57768 344 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 IL5RAQ01344 420 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TRIM32Q13049 653 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PPIL2Q13356 520 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RETREG3Q86VR2 466 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FBXO30Q8TB52 745 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms