RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2U1Q7Z449 544 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PWWP2AQ96N64 755 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 OMDQ99983 421 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 HERPUD2Q9BSE4 406 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CALN1Q9BXU9 219 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC134Q9H6E4 229 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 SCINQ9Y6U3 715 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 EPG5Q9HCE0 2579 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKCGP05129 697 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RETP07949 1114 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ERCC2P18074 760 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ENPP1P22413 925 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CD6P30203 668 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 STIP1P31948 543 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ARSIQ5FYB1 569 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC63Q8NA47 563 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 HOMER3Q9NSC5 361 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 UBAP1Q9NZ09 502 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 LNP1A1A4G5 178 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 MEI4A8MW99 385 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TCP11X1B4DZS4 312 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RASA4BC9J798 803 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RASA4O43374 803 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 MGRN1O60291 552 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX3O60493 162 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ZMPSTE24O75844 475 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 L1CAMP32004 1257 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 KYNUQ16719 465 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 LYSMD4Q5XG99 296 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RFX8Q6ZV50 586 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM42Q8IWZ5 723 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 EPAS1Q99814 870 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC39A8Q9C0K1 460 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNK9Q9NPC2 374 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ITM2CQ9NQX7 267 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 WNT9AO14904 365 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ZZEF1O43149 2961 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 UBOX5O94941 541 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RHOQP17081 205 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGA8P53708 1063 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH6P55285 790 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTN1Q12860 1018 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 C5orf22Q49AR2 442 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC50Q8IVM0 306 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 GDAP1Q8TB36 358 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 NTAN1Q96AB6 310 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 EBF2Q9HAK2 575 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 WHRNQ9P202 907 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TBK1Q9UHD2 729 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MX80 341 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 HGSO14964 777 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 INSIG1O15503 277 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 LEFTY1O75610 366 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX19P40855 299 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS6KA3P51812 740 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 OXCT1P55809 520 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2CBP62714 309 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2CAP67775 309 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA3BQ13214 749 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 C22orf39Q6P5X5 142 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR23CQ6ZRP0 262 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 GIMAP7Q8NHV1 300 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 FZD3Q9NPG1 666 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM248Q9NWD8 314 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP192Q8TEP8 1941 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.65□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms