RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC39A13Q96H72 371 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PANX3Q96QZ0 392 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM209Q96SK2 561 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TRMOQ9BU70 441 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 OSER1Q9NX31 292 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SCOCQ9UIL1 159 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CDH22Q9UJ99 828 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.27□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A088AWK7 358 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 H7C4K7 107 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DCXO43602 365 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 BNIP3LO60238 219 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 RAMP2O60895 175 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TADA2AO75478 443 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 AHSGP02765 367 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FGF1P05230 155 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 HLA-DPA1P20036 260 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGAXP20702 1163 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 GLDCP23378 1020 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MPSTP25325 297 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 YWHAQP27348 245 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3R1P27986 724 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 AVPR1AP37288 418 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCG1P45844 678 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1G1P47890 313 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 HTRA3P83110 453 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MPP1Q00013 466 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CTBSQ01459 385 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 RING1Q06587 406 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 IL10RBQ08334 325 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ITKQ08881 620 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DENND5AQ6IQ26 1287 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 RANBP10Q6VN20 620 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 KYQ8NBH2 561 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO32Q969P5 355 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MIEF2Q96C03 454 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT43Q96FT9 208 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 FEM1CQ96JP0 617 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF599Q96NL3 588 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NMUR1Q9HB89 426 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 S100A14Q9HCY8 104 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5MQ9NPB1 228 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF358Q9NW07 568 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 GMIPQ9P107 970 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC78A2IDD5 438 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM24O75264 130 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 BAG2O95816 211 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGB1P05556 798 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 CD86P42081 329 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 GLRBP48167 497 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 TM4SF4P48230 202 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-222ENST00000592408 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms