RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 CDC14BO60729 498 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 KINO60870 393 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TK1P04183 234 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ANXA6P08133 673 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SP9P0CG40 484 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CR2P20023 1033 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 LRPAP1P30533 357 aa8.07□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC11A1P49279 550 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ASIC1P78348 528 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TRPC3Q13507 836 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ATP1A4Q13733 1029 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.07□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC51Q96ER9 411 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.07□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CUEDC2Q9H467 287 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.07□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 RAD54BQ9Y620 910 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 TRIP11Q15643 1979 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.07□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ST8SIA2Q92186 375 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 PAGE5Q96GU1 130 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 CDT1Q9H211 546 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.06□□□□□ -1.12
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ATG4D-210ENST00000588972 TBX20Q9UMR3 447 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DAPP1Q9UN19 280 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GDAQ9Y2T3 454 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CITO14578 2027 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ANK1P16157 1881 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.06□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ARL5CA6NH57 179 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 H0YCG3 227 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 INPPL1O15357 1258 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 SRGAP2O75044 1071 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 RECQL4O94761 1208 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 DDHD2O94830 711 aa8.05□□□□□ -1.12
ATG4D-210ENST00000588972 GCNT3O95395 438 aa8.05□□□□□ -1.12
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