RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	AK8	Q96MA6	479 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTM3	Q96MX0	182 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DACH2	Q96NX9	599 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM237	Q96Q45	408 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GCNA	Q96QF7	691 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT17	Q9BSW7	474 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	STRA6	Q9BX79	667 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OPA3	Q9H6K4	179 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KAT14	Q9H8E8	782 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX15	Q9NRS6	342 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS51	Q9UID3	782 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		2.92	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRD1	A4D1F6	860 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YAE9	185 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BNX3	289 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC188	H7C350	402 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C4K7	107 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DNM1L	O00429	736 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CES2	O00748	559 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	DSCR3	O14972	297 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PGRMC2	O15173	223 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CBFA2T3	O75081	653 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RASAL1	O95294	804 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OPN1MW	P04001	364 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	WEE2	P0C1S8	567 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC159	P0C7I6	412 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PSG1	P11464	419 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RARG	P13631	454 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SELL	P14151	372 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CHN1	P15882	459 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TFEB	P19484	476 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCH	P24723	683 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	UQCRC1	P31930	480 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ICAM3	P32942	547 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	AMPH	P49418	695 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LIG4	P49917	911 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TKTL1	P51854	596 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC12A3	P55017	1021 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH8	P55286	799 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TIRAP	P58753	221 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OLR1	P78380	273 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CFHR1	Q03591	330 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R5B	Q15173	497 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC24	Q50LG9	513 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF585B	Q52M93	769 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CST9LP1	Q5W188	147 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KDELC1	Q6UW63	502 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST9	Q7L1S5	443 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM110	Q86TL2	294 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RFX6	Q8HWS3	928 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	LINS1	Q8NG48	757 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF18A	Q8NI77	898 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SETD6	Q8TBK2	473 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT35	Q92764	455 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP4K1	Q92918	833 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	ARSG	Q96EG1	525 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	PERP	Q96FX8	193 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	KAZALD1	Q96I82	304 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC17	Q96LX7	622 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AKAP13-223	ENST00000560957	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	2.91	□□□□□ -1.94

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