RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 XKR8Q9H6D3 395 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PALMDQ9NP74 551 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 THAP1Q9NVV9 213 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 STK26Q9P289 416 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PEMTQ9UBM1 199 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 HESX1Q9UBX0 185 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MAD2L2Q9UI95 211 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 HAO1Q9UJM8 370 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TEX264Q9Y6I9 313 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 U3KQV3 271 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 IL16Q14005 1332 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CFAP73A6NFT4 308 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ZNF839A8K0R7 811 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 BIN1O00499 593 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ATP2A1O14983 1001 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 USP12O75317 370 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CRCPO75575 148 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RHOBTB1O94844 696 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 IL1AP01583 271 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KRT6BP04259 564 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CYBBP04839 570 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PCCBP05166 539 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KRT8P05787 483 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GALTP07902 379 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CCDC130P13994 396 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GYPEP15421 78 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 AREGP15514 252 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ATP5JP18859 108 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FDXRP22570 491 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 YY1P25490 414 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PON1P27169 355 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CFPP27918 469 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ALDH4A1P30038 563 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 FMO4P31512 558 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KRT6CP48668 564 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PRKAG1P54619 331 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NAGLUP54802 743 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PRRX1P54821 245 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 NPEPPSP55786 919 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SPIBQ01892 262 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SP2Q02086 613 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TAP1Q03518 808 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OVGP1Q12889 678 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PLD1Q13393 1074 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RUNX2Q13950 521 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DOC2AQ14183 400 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RCN1Q15293 331 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SNAPC1Q16533 368 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 CYP2A13Q16696 494 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C6orf136Q5SQH8 315 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 AFMIDQ63HM1 303 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 KANK2Q63ZY3 851 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SLC23A3Q6PIS1 610 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 LAYNQ6UX15 382 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 SYVN1Q86TM6 617 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 DNAJC10Q8IXB1 793 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 C4orf19Q8IY42 314 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-232ENST00000552331 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms