RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526105.5

SLC38A6-208, Transcript of solute carrier family 38 member 6, human

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A6-208	ENST00000526105	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105		A0A1W2PRG0	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	BECN2	A8MW95	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	KLK8	O60259	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PAGE4	O60829	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	BMP15	O95972	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MMP2	P08253	660 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	HOXB2	P14652	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ITGAX	P20702	1163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	GPT	P24298	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	OLIG2	Q13516	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NEDD9	Q14511	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SLC38A6-208	ENST00000526105	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	AP3D1	O14617	1153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TOMM40	O96008	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	LCAT	P04180	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	AGA	P20933	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MLH1	P40692	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	NUDT6	P53370	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PGGT1B	P53609	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PMS2	P54278	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SORD	Q00796	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TRAF1	Q13077	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TRIB2	Q92519	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PERP	Q96FX8	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	RGS14	O43566	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SHMT1	P34896	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PRAME	P78395	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	GPS2	Q13227	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	NAE1	Q13564	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SHB	Q15464	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SLC38A6-208	ENST00000526105	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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