RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 FBXL8Q96CD0 374 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 HVCN1Q96D96 273 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 DONSONQ9NYP3 566 aa4.3□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.3□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 CPED1A4D0V7 1026 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 SOCS6O14544 535 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 WNT9BO14905 357 aa4.29□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 GAGE12GP0CL81 117 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 GAGE12IP0CL82 117 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 G6PDP11413 515 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 CD58P19256 250 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 ITGAXP20702 1163 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 EFNA5P52803 228 aa4.29□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 UFM1P61960 85 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 TLE2Q04725 743 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 GALNT2Q10471 571 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 GAGE1Q13065 139 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 GAGE4Q13068 117 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 TCTN1Q2MV58 587 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 AMZ1Q400G9 498 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 C9orf50Q5SZB4 431 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 WDR73Q6P4I2 378 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 DSELQ8IZU8 1212 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 CPXCR1Q8N123 301 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 POC1AQ8NBT0 407 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 APOPT1Q96IL0 206 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL15Q96M94 604 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 EPYCQ99645 322 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 VEZTQ9HBM0 779 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 GAGE10A6NGK3 116 aa4.28□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN4O14817 238 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 TIPRLO75663 272 aa4.28□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 HEXAP06865 529 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 COX7A2P14406 83 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 DLX5P56178 289 aa4.28□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 LCTLQ6UWM7 567 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.28□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 TANKQ92844 425 aa4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
CPEB4-210ENST00000522344 PKP4Q99569 1192 aa4.28□□□□□ -1.72
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CPEB4-210ENST00000522344 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.27□□□□□ -1.73
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CPEB4-210ENST00000522344 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
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CPEB4-210ENST00000522344 MMP2P08253 660 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 IRF1P10914 325 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 AGAP20933 346 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 PAFAH1B1P43034 410 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 POU5F1BQ06416 359 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.27□□□□□ -1.73
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
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