RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512416.5

SPATA20-222, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 3

Gene SPATA20, Length 845 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CNTN5	O94779	1100 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CSF2	P04141	144 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ITGB7	P26010	798 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	HTR7	P34969	479 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CDKN2B	P42772	138 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	DNA2	P51530	1060 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	THOP1	P52888	689 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	DPYS	Q14117	519 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	KRT81	Q14533	505 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	NR0B2	Q15466	257 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ALF	Q53S48	1182 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	EPAS1	Q99814	870 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	FZD3	Q9NPG1	666 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416		H3BRJ5	948 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	TOR1B	O14657	336 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	AQP9	O43315	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	LEFTY1	O75610	366 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CTSL	P07711	333 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ADRB3	P13945	408 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PTPN7	P35236	360 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CLDN2	P57739	230 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	TPI1	P60174	286 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	COPS2	P61201	443 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ASB12	Q8WXK4	309 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PSMB7	Q99436	277 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	CARD9	Q9H257	536 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPATA20-222	ENST00000512416	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	SNAP91	O60641	907 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	MT-CO1	P00395	513 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	TUBB4A	P04350	444 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	KRT10	P13645	584 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	C6	P13671	934 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	JUND	P17535	347 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	ERCC2	P18074	760 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	AMPD1	P23109	780 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	EPHB2	P29323	1055 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	CASQ1	P31415	396 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	CXCR5	P32302	372 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	ARL4A	P40617	200 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	BLK	P51451	505 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	RAD51	Q06609	339 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPATA20-222	ENST00000512416	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.33	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms