RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ITSN1	Q15811	1721 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	NOTCH4	Q99466	2003 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	USP32	Q8NFA0	1604 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593		A6NNC1	897 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TNFSF14	O43557	240 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	DDAH2	O95865	285 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF853	P0CG23	659 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CHRNB1	P11230	501 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KLRC2	P26717	231 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	PGGT1B	P53609	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	UFM1	P61960	85 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ZXDB	P98169	803 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KRT32	Q14532	448 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	GPR68	Q15743	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	RPE65	Q16518	533 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	PLK5	Q496M5	336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	GPSM1	Q86YR5	675 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CNTROB	Q8N137	903 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KAT2B	Q92831	832 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TIGD1	Q96MW7	591 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	HIPK3	Q9H422	1215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	FZD3	Q9NPG1	666 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	DONSON	Q9NYP3	566 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KIF3A	Q9Y496	699 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KIAA0232	Q92628	1395 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ATP7B	P35670	1465 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CCER2	I3L3R5	266 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TULP2	O00295	520 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CBX6	O95503	412 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	NFATC1	O95644	943 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ADA	P00813	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TGFB3	P10600	412 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	UBL4A	P11441	157 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KRT9	P35527	623 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	DDIT3	P35638	169 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNJ4	P48050	445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CAMK1	Q14012	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	KLB	Q86Z14	1044 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	UCMA	Q8WVF2	138 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	BRF2	Q9HAW0	419 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ABCE1-208	ENST00000509593	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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