RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496124.1

PRDM15-216, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-216ENST00000496124 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.6□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 AMACRQ9UHK6 382 aa14.6□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 DMDP11532 3685 aa14.6□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.6□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 PLXNA2O75051 1894 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 AP1G1O43747 822 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 GDF9O60383 454 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 TM7SF2O76062 418 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 WNT1P04628 370 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 PCCBP05166 539 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 ETS1P14921 441 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 LHCGRP22888 699 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 AKT2P31751 481 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 CHRNA4P43681 627 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 KCNJ1P48048 391 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 WNT3AP56704 352 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 SPARCL1Q14515 664 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 ACOX1Q15067 660 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 CNGA3Q16281 694 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 DPPA4Q7L190 304 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 EDEM2Q9BV94 578 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 SNX12Q9UMY4 172 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 USP34Q70CQ2 3546 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM15-216ENST00000496124 LNP1A1A4G5 178 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 FANCGO15287 622 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 LATO43561 262 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 USP12O75317 370 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 PRLP01236 227 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 ENGP17813 658 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 VIPR1P32241 457 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 VPS41P49754 854 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 C21orf59P57076 290 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 IL9RQ01113 521 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 GRIK2Q13002 908 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 ARHGEF7Q14155 803 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 STAT4Q14765 748 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 TEAD4Q15561 434 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CSRP2Q16527 193 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 QPCTQ16769 361 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 LRRC66Q68CR7 880 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 PBKQ96KB5 322 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 VAT1Q99536 393 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 USP29Q9HBJ7 922 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CD84Q9UIB8 345 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 KNL1Q8NG31 2342 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CTAGE9A4FU28 777 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CAPN8A6NHC0 703 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 FZD6O60353 706 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF806P0C7X5 589 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 KCNA4P22459 653 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CES1P23141 567 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 HNF1BP35680 557 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 IGFALSP35858 605 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 CDK18Q07002 472 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 IRF4Q15306 451 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 KIF19Q2TAC6 998 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 NEK5Q6P3R8 708 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 KDELC1Q6UW63 502 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 LIPIQ6XZB0 460 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM15-216ENST00000496124 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms