RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF3	P17036	446 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CAPN3	P20807	821 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC16A2	P36021	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	RFX2	P48378	723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CCT5	P48643	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PHEX	P78562	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	LTB	Q06643	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	AP1B1	Q10567	949 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ABCC9	O60706	1549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PODXL	O00592	558 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC7A4	O43246	635 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	MBD4	O95243	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CAVIN2	O95810	425 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	GLP2R	O95838	553 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	MT-ND3	P03897	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	IVL	P07476	585 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	HOXC6	P09630	235 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP5O	P48047	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	DSTN	P60981	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SHC2	P98077	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	UBXN1	Q04323	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	EGR4	Q05215	589 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SNX1	Q13596	522 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	STK11	Q15831	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	USH1G	Q495M9	461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672		Q5PR19	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	MED30	Q96HR3	178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CCDC66-222	ENST00000494672	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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