RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 EPHB2P29323 1055 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ALDH4A1P30038 563 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CCKBRP32239 447 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SOX5P35711 763 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MMP12P39900 470 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PTPN9P43378 593 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GNPDA1P46926 289 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RGRP47804 291 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 POLD2P49005 469 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CSRP3P50461 194 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PEX5P50542 639 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SUOXP51687 545 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OR1D5P58170 312 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TPI1P60174 286 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 UBE2HP62256 183 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CDR2Q01850 454 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RALGDSQ12967 914 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PTP4A2Q12974 167 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 BIRC2Q13490 618 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MTM1Q13496 603 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SERINC3Q13530 473 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CLCA4Q14CN2 919 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 C16orf72Q14CZ0 275 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ACOX1Q15067 660 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SYCP1Q15431 976 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TBR1Q16650 682 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 UGP2Q16851 508 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PARP15Q460N3 678 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 COLEC12Q5KU26 742 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NKAIN2Q5VXU1 208 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DENND2CQ68D51 928 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ERAP2Q6P179 960 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DNAJC24Q6P3W2 148 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DCUN1D2Q6PH85 259 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 WDR59Q6PJI9 974 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LVRNQ6Q4G3 990 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TRIM72Q6ZMU5 477 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATG14Q6ZNE5 492 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARCQ7LC44 396 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 STRADAQ7RTN6 431 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SPRED1Q7Z699 444 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SLFN11Q7Z7L1 901 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SRLQ86TD4 932 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF677Q86XU0 584 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DNAAF5Q86Y56 855 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PELI3Q8N2H9 469 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MLKLQ8NB16 471 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RCBTB1Q8NDN9 531 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GPR156Q8NFN8 814 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OR6C4Q8NGE1 309 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OR56A4Q8NGH8 313 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATL2Q8NHH9 583 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CCL4L1Q8NHW4 92 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HTR3CQ8WXA8 447 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PMEPA1Q969W9 287 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NTAN1Q96AB6 310 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RNF31Q96EP0 1072 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CMKLR1Q99788 373 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NUDT22Q9BRQ3 303 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LGR4Q9BXB1 951 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 STK33Q9BYT3 514 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZMYND15Q9H091 742 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM168Q9H0V1 697 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GANQ9H2C0 597 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DPEP2Q9H4A9 486 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RETREG1Q9H6L5 497 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SP110Q9HB58 689 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RDH14Q9HBH5 336 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FGF22Q9HCT0 170 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms