RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433271.6

TMEM248-205, Transcript of transmembrane protein 248, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM248, Length 1,610 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248-205ENST00000433271 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.58■■□□□ 1.85
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TMEM248-205ENST00000433271 SPAG6O75602 509 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 PRKCGP05129 697 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 CTPS1P17812 591 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 ITGB7P26010 798 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 ABL2P42684 1182 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 GPX6P59796 221 aa26.57■■□□□ 1.84
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TMEM248-205ENST00000433271 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.842e-7■■■□□ 19.1
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TMEM248-205ENST00000433271 SLC29A2Q14542 456 aa26.56■■□□□ 1.84
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TMEM248-205ENST00000433271 UPK3BL2E5RIL1 263 aa26.55■■□□□ 1.84
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TMEM248-205ENST00000433271 Q6ZS52 159 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.54■■□□□ 1.84
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TMEM248-205ENST00000433271 FOXQ1Q9C009 403 aa26.54■■□□□ 1.84
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TMEM248-205ENST00000433271 PDE1BQ01064 536 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 CDKN3Q16667 212 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 HDAC8Q9BY41 377 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 FUT8Q9BYC5 575 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TMEM248-205ENST00000433271 TREX1Q9NSU2 369 aa26.54■■□□□ 1.84
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