RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MMP2P08253 660 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 ME2P23368 584 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 STX5Q13190 355 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 BFSP2Q13515 415 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PEX6Q13608 980 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 PARP15Q460N3 678 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 RCN3Q96D15 328 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CATSPER2Q96P56 530 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 CDRT15Q96T59 188 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 NT5MQ9NPB1 228 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 VWA7Q9Y334 891 aa23.9■■□□□ 1.42
PMS1-205ENST00000409985 AHCYL1O43865 530 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 CAPNS1P04632 268 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 FAM189BP81408 668 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 NFKB2Q00653 900 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 SULT2A1Q06520 285 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 ART3Q13508 389 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 NXNQ6DKJ4 435 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 TOP1MTQ969P6 601 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 HMCESQ96FZ2 354 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 WDR41Q9HAD4 459 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 SP110Q9HB58 689 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.89■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 A8MT66 165 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0355O15063 1070 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 CSHL1Q14406 222 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 SQLEQ14534 574 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 SFT2D3Q587I9 215 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 HECTD2Q5U5R9 776 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 GPR150Q8NGU9 434 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 L3HYPDHQ96EM0 354 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 ASB2Q96Q27 587 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 OLFM1Q99784 485 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 EBF3Q9H4W6 596 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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PMS1-205ENST00000409985 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.88■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 AP1G1O43747 822 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 IMPDH1P20839 514 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 PBX3P40426 434 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 CD86P42081 329 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 ATP4BP51164 291 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 RING1Q06587 406 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 GRM2Q14416 872 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 TRIP10Q15642 601 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.87■■□□□ 1.41
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PMS1-205ENST00000409985 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.87■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 FLOT2Q14254 428 aa23.87■■□□□ 1.41
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PMS1-205ENST00000409985 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.87■■□□□ 1.41
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PMS1-205ENST00000409985 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
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PMS1-205ENST00000409985 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.85■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.85■■□□□ 1.41
PMS1-205ENST00000409985 TRIM38O00635 465 aa23.85■■□□□ 1.41
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