RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365488.1

RNU6-652P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 652, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-652P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-652P-201ENST00000365488 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 A0A1W2PP11 408 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 A0A1W2PQ72 361 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 A0A1W2PQM1 296 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 hDV102S1A0JD36 115 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 POM121BA6NF01 834 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SMIM1B2RUZ4 78 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 B9A039 149 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 HHLA1C9JL84 531 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 KLRF2D3W0D1 207 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GRM8O00222 908 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 APAF1O14727 1248 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 KPNA5O15131 536 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 IRAK2O43187 625 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 THAP12O43422 761 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 TSPAN6O43657 245 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 PCDH7O60245 1069 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZIC3O60481 467 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CTSVO60911 334 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 RGS11O94810 467 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CLSTN1O94985 981 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 LARGE1O95461 756 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 MLYCDO95822 493 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GLP2RO95838 553 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 FTCDO95954 541 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CH25HO95992 272 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SERPINC1P01008 464 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 IGKV3-11P04433 115 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 TPOP07202 933 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CSF1P09603 554 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CETPP11597 493 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CKMT1AP12532 417 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 MYL4P12829 197 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CEACAM1P13688 526 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF32P17041 273 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ITGA2P17301 1181 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CEBPBP17676 345 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CTPS1P17812 591 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 EDN2P20800 178 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SERPINB3P29508 390 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SHMT1P34896 483 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GRK5P34947 590 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 HNF1BP35680 557 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GJC1P36383 396 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 LIFRP42702 1097 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 STT3AP46977 705 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 HSPA7P48741 367 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 MMP14P50281 582 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CLCNKBP51801 687 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 EFNA5P52803 228 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 LIMK2P53671 638 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CLDN2P57739 230 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 NLRP5P59047 1200 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ISL1P61371 349 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ARHGAP8P85298 464 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 PPARDQ03181 441 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 COX10Q12887 443 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GRIK3Q13003 919 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GPS1Q13098 491 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CAPSQ13938 189 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 LY6DQ14210 128 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GALNT3Q14435 633 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPARCL1Q14515 664 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC18A3Q16572 532 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ME3Q16798 604 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 BTBD16Q32M84 506 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 KIAA1644Q3SXP7 199 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 RNF212Q495C1 297 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 GALNTL6Q49A17 601 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 C5orf22Q49AR2 442 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ALG10Q5BKT4 473 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 TECRLQ5HYJ1 363 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ALG10BQ5I7T1 473 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 KCNT1Q5JUK3 1230 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 FAM171A1Q5VUB5 890 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 IZUMO3Q5VZ72 239 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 TANGO2Q6ICL3 276 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 LCN10Q6JVE6 187 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 LIN54Q6MZP7 749 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF280DQ6N043 979 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 RINT1Q6NUQ1 792 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 RGMBQ6NW40 437 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC27A1Q6PCB7 646 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 BHLHB9Q6PI77 547 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-652P-201ENST00000365488 C17orf99Q6UX52 265 aa0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms