RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.28■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 C7orf72A4D263 438 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 NEMP1O14524 444 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 H6PDO95479 791 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 GLRBP48167 497 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 FAM171BQ6P995 826 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 EPGNQ6UW88 154 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 VPS39Q96JC1 886 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 ACBD6Q9BR61 282 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CDH19Q9H159 772 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TK2O00142 265 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 TIMM44O43615 452 aa20.27■□□□□ 0.84
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HPS6-201ENST00000299238 METTL23Q86XA0 190 aa20.27■□□□□ 0.84
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HPS6-201ENST00000299238 OR52B2Q96RD2 323 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SPC25Q9HBM1 224 aa20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
HPS6-201ENST00000299238 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.27■□□□□ 0.84
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HPS6-201ENST00000299238 CNTD1Q8N815 330 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 HPS1Q92902 700 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 TAMM41Q96BW9 452 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.26■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 TMEM114B3SHH9 223 aa20.26■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.26■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.26■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 ZNF623O75123 536 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 CYP11A1P05108 521 aa20.25■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 SLC15A4Q8N697 577 aa20.25■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 PKMYT1Q99640 499 aa20.25■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 RNF148Q8N7C7 305 aa20.25■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.25■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.25■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 NEU3Q9UQ49 428 aa20.25■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 H3BNH8 94 aa20.24■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 NUMBP49757 651 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ZNF460Q14592 562 aa20.24■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 SBK3P0C264 359 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 DSC3Q14574 896 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.24■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 TASP1Q9H6P5 420 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 GABRQQ9UN88 632 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.24■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 A0A0U1RQF3 1178 aa20.23■□□□□ 0.83
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