RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222329.8

ERF-201, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ERF, Length 2,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-201ENST00000222329 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 SUPT7LO94864 414 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 VNN2O95498 520 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 BIRC2Q13490 618 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 RTP2Q5QGT7 225 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 CUZD1Q86UP6 607 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 LGI2Q8N0V4 545 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 OR7D4Q8NG98 312 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 WDR41Q9HAD4 459 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 SCOCQ9UIL1 159 aa22.83■■□□□ 1.25
ERF-201ENST00000222329 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PTPRRQ15256 657 aa22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 GATA6Q92908 595 aa22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.83■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 MROH6A6NGR9 719 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TLR5O60602 858 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 NME5P56597 212 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 SERINC3Q13530 473 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 KBTBD6Q86V97 674 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CALML6Q8TD86 181 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PTERQ96BW5 349 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 MTMR11A4FU01 709 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PRKAA2P54646 552 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PFKPQ01813 784 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ZNF235Q14590 738 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 LAYNQ6UX15 382 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 VPS45Q9NRW7 570 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.242e-7■■□□□ 14.2
ERF-201ENST00000222329 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.82■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TXNDC9O14530 226 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 NPHS1O60500 1241 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CLCN5P51795 746 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 KLC3Q6P597 504 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 UBXN10Q96LJ8 280 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ENO4A6NNW6 628 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 SLC6A4P31645 630 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TM4SF4P48230 202 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 FLOT2Q14254 428 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 C16orf89Q6UX73 402 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TTC16Q8NEE8 873 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PIDD1Q9HB75 910 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ADA2Q9NZK5 511 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 AK5Q9Y6K8 562 aa22.81■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ADAM12O43184 909 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 POLD2P49005 469 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 NKX3-2P78367 333 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ISCA2Q86U28 154 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 LCA5Q86VQ0 697 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PDSS2Q86YH6 399 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 STK39Q9UEW8 545 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 CAPN8A6NHC0 703 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 AOC2O75106 756 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 LYNP07948 512 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 RGRP47804 291 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 SLC11A1P49279 550 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 TEX26Q8N6G2 289 aa22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ERF-201ENST00000222329 KLHL4Q9C0H6 718 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms