RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 CYP17A1P05093 508 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 CSH2P0DML3 217 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.66□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 SUV39H1O43463 412 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 C19orf81C9J6K1 198 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF543Q08ER8 600 aa14.66□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 PBRM1Q86U86 1689 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 POMCP01189 267 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 CHAF1BQ13112 559 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 TMEM68Q96MH6 324 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 FTH1P02794 183 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 S100PBPQ96BU1 408 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 PXMP2Q9NR77 195 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 MED31Q9Y3C7 131 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 LINC00032P0C843 101 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF286BP0CG31 522 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 IL22Q9GZX6 179 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.65□□□□□ -0.06
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SPTLC2-201ENST00000216484 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 USP17L7P0C7H9 530 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 GADD45AP24522 165 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 LNX2Q8N448 690 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 CERKQ8TCT0 537 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 TBX22Q9Y458 520 aa14.65□□□□□ -0.06
SPTLC2-201ENST00000216484 ITGB1P05556 798 aa14.65□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 NAMPTP43490 491 aa14.65□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 GRIA4P48058 902 aa14.65□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PFKPQ01813 784 aa14.65□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.65□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 LGI2Q8N0V4 545 aa14.65□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PHB2Q99623 299 aa14.65□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 TREM1Q9NP99 234 aa14.65□□□□□ -0.07
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