RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 StambpQ9CQ26 424 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Exoc2Q9D4H1 924 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdyl2Q9D5D8 503 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rsc1a1Q9ER99 582 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myo1cQ9WTI7 1063 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Coro1cQ9WUM4 474 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eml5Q8BQM8 1977 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttll9A2APC3 461 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mroh7A2AVR2 1279 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Skint11A7XV14 364 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kifc5bE9PUA5 672 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Capn2O08529 700 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc22a2O70577 553 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab10P61027 200 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nxpe4Q52KP5 543 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zbtb33Q8BN78 671 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tgif2Q8C0Y1 237 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bend5Q8C6D4 421 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NeproQ8R2U2 564 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lars2Q8VDC0 902 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 L3hypdhQ9CXA2 354 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Capn7Q9R1S8 813 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tle6Q9WVB3 581 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Clcn5Q9WVD4 746 aa20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TriobpQ99KW3 2014 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lilra6A0A0B4J1F3 663 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6309L7N481 315 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stx7O70439 261 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PolP11369 1281 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ChgbP16014 677 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Thumpd3P97770 505 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab33aP97950 237 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxw18Q3TSA9 469 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr834Q7TRG8 312 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr366Q7TRY4 309 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zbtb9Q8CDC7 459 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sirt3Q8R104 334 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q9DA42 136 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr703Q9EPF5 319 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ndst3Q9EQH7 873 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Shcbp1Q9Z179 668 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ap1s1P61967 158 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stx2Q00262 289 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SbplQ3TUY3 232 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cog7Q3UM29 770 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gas6Q61592 674 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Grid2Q61625 1007 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stx3Q64704 289 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ScapQ6GQT6 1276 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arl5aQ80ZU0 179 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc41a1Q8BJA2 512 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab44Q8CB87 725 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plpp3Q99JY8 312 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CatsperzQ9CQP8 194 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CenpsQ9D084 142 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chrac1Q9JKP8 129 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RhoaQ9QUI0 193 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14459A2BI73 179 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm20828J3KMI7 228 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn2r54K7N649 806 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ncam2O35136 837 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smpd2O70572 419 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adcy1O88444 1118 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01740 135 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 BpgmP15327 259 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt6aP50446 553 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gjb5Q02739 271 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abl2Q4JIM5 1182 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp11bQ6DFW5 1175 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mtmr12Q80TA6 747 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pnma8aQ80VM8 430 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Podxl2Q8CAE9 603 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnm1lQ8K1M6 742 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp2c70Q91W64 489 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Snrnp48Q9D361 337 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc22a17Q9D9E0 401 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Csnk1dQ9DC28 415 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc29a1Q9JIM1 460 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abhd1Q9QZC8 412 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp952B0V2W4 504 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr600E9PUN7 314 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DldO08749 509 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ifrd1P19182 449 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RabggtbP53612 339 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zhx1P70121 873 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Serping1P97290 504 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Serpinb6Q60854 378 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnfaip2Q61333 691 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr293Q7TS10 336 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Elmo2Q8BHL5 732 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ston2Q8BZ60 895 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.5 ms