RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000087050.6

Col4a4-201, Transcript of Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col4a4, Length 10,108 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Depdc1aQ8CIG0 804 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Oxnad1Q8VE38 311 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Epn3Q91W69 636 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm7971J3QMM8 481 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 PenkP22005 268 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Chrna5Q2MKA5 467 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Xkr9Q5GH62 373 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zfp90Q61967 636 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gdpd5Q640M6 607 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ttc8Q8VD72 515 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Acbd7Q9D258 88 aa10□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Lta4hP24527 611 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Atg4cQ811C2 458 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tmem17Q8K0U3 198 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Abcb9Q9JJ59 762 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tinf2Q9QXG9 341 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slc26a3Q9WVC8 757 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ric1Q69ZJ7 1422 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Mkrn2osD3Z393 217 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm3476K7N6V0 257 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Serpinb9eO08806 377 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 H2-Q1O19441 368 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Clk3O35492 638 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Clcn3P51791 818 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 NkaplQ5SZT7 395 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gpd2Q64521 727 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slc25a23Q6GQS1 467 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zbtb24Q80X44 710 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 DhddsQ99KU1 333 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Clcc1Q99LI2 539 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ndufaf6A2AIL4 333 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zfp969A2ART2 485 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zfp973A2BE20 318 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rab21P35282 222 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Q32M26 199 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Txndc8Q69AB2 127 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rasa4Q6PFQ7 802 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Pin4Q9CWW6 131 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Prelid3bQ9CYY7 195 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Uqcrc1Q9CZ13 480 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Tlr4Q9QUK6 835 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm45902Q3UDN3 361 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Sez6lQ6P1D5 963 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Trit1Q80UN9 467 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Fmo2Q8K2I3 535 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Memo1Q91VH6 297 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Snapc2Q91XA5 359 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 LiasQ99M04 373 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cpxm2Q9D2L5 764 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Sult6b2B7ZWN4 290 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm3095E9Q058 166 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Akap3O88987 864 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Icam1P13597 537 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Oprl1P35377 367 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Stat5aP42230 793 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cdh9P70407 786 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Grm1P97772 1199 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Nuak2Q8BZN4 639 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Kat5Q8CHK4 513 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Sec14l2Q99J08 403 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Krt88Q9CPR6 171 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 EcdQ9CS74 641 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gpn3Q9D3W4 284 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cntd1Q9D995 334 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Smurf2A2A5Z6 748 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Syndig1A2ANU3 258 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm10324L7N208 604 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 TpmtO55060 240 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Mpzl2O70255 215 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Znf800Q0VEE6 662 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Colec11Q3SXB8 272 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Lrrc55Q3UY51 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cspg5Q71M36 566 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Pcdh19Q80TF3 1145 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rdh13Q8CEE7 334 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Txndc11Q8K2W3 948 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Acvr1cQ8K348 493 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Iqsec1Q8R0S2 961 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ergic2Q9CR89 377 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Rasgef1cQ9D300 466 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Slc9a3G3X939 829 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Vmn2r53L7N473 806 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Dnajb14Q149L6 379 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Hspbap1Q8BK58 483 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Lrrc42Q8R2U7 421 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Lpgat1Q91YX5 370 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Ndufb5Q9CQH3 189 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Aldh9a1Q9JLJ2 494 aa9.99□□□□□ -0.81
Col4a4-201ENSMUST00000087050 Gm5114W4VSN8 858 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms