RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpm4Q7TN37 1213 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1062Q7TR71 315 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Proser3Q7TSA6 634 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sfr1Q8BP27 319 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arfip2Q8K221 341 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acap1Q8K2H4 740 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp566Q8VCI1 386 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr695Q8VFM3 315 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr371Q8VGB8 312 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BsndQ8VIM4 307 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx15Q91WE1 337 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GcshQ91WK5 170 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dlg2Q91XM9 852 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wrnip1Q91XU0 660 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anxa13Q99JG3 317 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csnk1dQ9DC28 415 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PolhQ9JJN0 694 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn7Q9R1S8 813 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtm1Q9Z2C5 603 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r25W4VSP2 855 aa9.31□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm12695A2AGB2 545 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam209A2APA5 170 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Iqca1lA6H690 825 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Osbpl8B9EJ86 889 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SelenovD3YXG1 328 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcp10cE9Q046 482 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtproE9Q612 1226 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7073E9QAS1 335 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prr22F6TNE3 422 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grip2G3XA20 1042 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EsrraO08580 422 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NmbrO54799 390 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tnk2O54967 1055 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd160O88875 185 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sp1O89090 784 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PdgfrbP05622 1098 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scd1P13516 355 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BpgmP15327 259 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptger1P35375 405 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PpargP37238 505 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stat5aP42230 793 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ap1s1P61967 158 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmb4P99026 264 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbp1Q00915 135 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grin2cQ01098 1239 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nat9Q3UG98 241 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 StradaQ3UUJ4 431 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hbs1lQ69ZS7 682 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpa4Q6P8K8 420 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Casd1Q7TN73 797 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Insig1Q8BGI3 259 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dyrk4Q8BI55 632 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zcchc4Q8BKW4 512 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Robo4Q8C310 1012 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atg10Q8R1P4 215 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NeproQ8R2U2 564 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Camkk1Q8VBY2 505 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr846Q8VET8 312 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhga10Q91XY9 930 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 L2hgdhQ91YP0 464 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SardhQ99LB7 919 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrrc4Q99PH1 652 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rgs10Q9CQE5 181 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PgcQ9D7R7 392 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc39a5Q9D856 535 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AvenQ9D9K3 342 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf654Q9DAU9 571 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syde1Q9DBZ9 737 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ndst3Q9EQH7 873 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tlr9Q9EQU3 1032 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rsc1a1Q9ER99 582 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abhd1Q9QZC8 412 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Asb3Q9WV72 525 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tp53bp1P70399 1969 aa9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mtx3D3YTP3 312 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 C6E9Q6D8 931 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn1r176G3UW31 304 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nsmce4aG3XA30 381 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Syngr1O55100 234 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rtn2O70622 471 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stam2O88811 523 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd4P06332 457 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Camk4P08414 469 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gas2P11862 314 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oprl1P35377 367 aa9.29□□□□□ -0.92
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gdf5P43027 495 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms