RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl14Q69ZK5 630 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr798Q7TRH8 311 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd3Q8C4H2 520 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clp1Q99LI9 425 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rwdd4Q9CPR1 188 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NfkbizQ9EST8 728 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdrd6P61407 2134 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3642K7N6V4 267 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r88L7N1W8 857 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AvilO88398 819 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LtfP08071 707 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crabp2P22935 138 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adcyap1r1P70205 496 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ItkQ03526 625 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coq10bQ3THF9 240 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brms1lQ3U1T3 323 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfe2l2Q60795 597 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpy19l3Q71B07 716 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fads6Q80UG1 342 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ostm1Q8BGT0 338 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itpk1Q8BYN3 419 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fnbp1lQ8K012 605 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssh3Q8K330 649 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plbd1Q8VCI0 550 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha6Q91Y14 946 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msi2Q920Q6 346 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Katnal2Q9D3R6 539 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D979 236 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpc7Q9WVC5 862 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plin4O88492 1403 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rp1P56716 2095 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1160A2AVT0 319 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A630010A05RikA9C473 232 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdelc2G5E897 503 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl3b1P09586 222 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh1a1P24549 501 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plxna3P70208 1872 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr1bP70700 1135 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NxnP97346 435 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3U4G0 281 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wee2Q66JT0 555 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt10Q6P9S7 603 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcg2Q7TMS5 657 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DcstampQ7TNJ0 470 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Noc4lQ8BHY2 516 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StgQ8BM15 349 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde10aQ8CA95 790 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem161aQ8VCA6 480 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Socs7Q8VHQ2 579 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ogfod2Q9CQ04 349 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgm3Q9CYR6 542 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdp2Q9JJX7 370 aa12.73□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdia2D3Z6P0 527 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8334F7CD45 553 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Folr1P35846 255 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SykP48025 629 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AxlQ00993 888 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf3Q07104 366 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsmem1Q3UQS2 128 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g4dQ50L43 825 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn2bQ56A07 215 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fzd6Q61089 709 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otud6aQ6IE21 290 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim62Q80V85 475 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrabdQ99JY4 376 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpc1Q9QZF2 557 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp5aE9QAS7 422 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf683I7HJS4 458 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OmdO35103 423 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnao1P18872 354 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmpr1aP36895 532 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt6aP50446 553 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DmwdQ08274 665 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd36Q08857 472 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ak8Q32M07 479 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp956Q3UZY6 572 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MafkQ61827 156 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Paqr6Q6TCG5 343 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a9Q7TM99 508 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.9 ms