RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Yod1Q8CB27 343 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bap1Q99PU7 728 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CabyrQ9D424 453 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slxl1Q9D515 155 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hspb11Q9D6H2 143 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 1700018B08RikQ9DA83 213 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cab39lQ9DB16 337 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slco1c1Q9ERB5 715 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Azi2Q9QYP6 405 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 C6E9Q6D8 931 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zbtb10E9Q8X5 861 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Map2k3O09110 347 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ppargc1aO70343 797 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CartptP56388 129 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Actr2P61161 394 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 WasP70315 520 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smad5P97454 465 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rtkn2Q14B46 604 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q3TTL0 348 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q3U7U4 132 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CcnyQ8BGU5 341 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NarsQ8BP47 559 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mul1Q8VCM5 352 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kctd10Q922M3 315 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc26a5Q99NH7 744 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vps28Q9D1C8 221 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rmdn1Q9DCV4 305 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rcan1Q9JHG6 198 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cngb3Q9JJZ9 694 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rai2Q9QVY8 529 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tk2Q9R088 270 aa9.3□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Myh2G3UW82 1942 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr485A0A140LJF5 317 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptpn3A2ALK8 913 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tyw5A2RSX7 315 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8298J3QPI0 401 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8011K7N6Y5 207 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DhfrP00375 187 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MaptP10637 733 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adcy7P51829 1099 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dynll1P63168 89 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SirpaP97797 513 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hephl1Q3V1H3 1159 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arnt2Q61324 712 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc36a3Q811P0 477 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q8CDN1 933 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acsm1Q91VA0 573 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zdhhc7Q91WU6 308 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 OptcQ920A0 328 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sept12Q9D451 317 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rsph9Q9D9V4 276 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Serpini2Q9JK88 405 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tob2Q9JM55 345 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 H2-OaQ9QWV1 250 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 A0A286YDU1 74 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Glb1l3A2RSQ1 649 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr521E9Q519 321 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sult2b1O35400 338 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mup3P04939 184 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BpgmP15327 259 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Irf3P70671 419 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp217Q3U0X6 1041 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Samd4bQ80XS6 687 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AardQ811W1 167 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trnt1Q8K1J6 434 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Plekhg6Q8R0J1 787 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Glra3Q91XP5 464 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BollQ924M5 281 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ripply3Q924S9 152 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cnot11Q9CWN7 505 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ap1s2Q9DB50 160 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tor3aQ9ER38 385 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ambra1A2AH22 1300 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc16a6B1AT66 607 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aldh3b3J3QMK6 479 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dnase1l3O55070 310 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clcn7O70496 803 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnc1P15388 511 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Glud1P26443 558 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ido1P28776 407 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Krt6aP50446 553 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf367Q0VDT2 340 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm4952Q5FW57 296 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scube3Q66PY1 993 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nlgn2Q69ZK9 836 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp82Q6P9Y7 530 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bhlhb9Q6PB60 539 aa9.29□□□□□ -0.92
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dpy19l3Q71B07 716 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.1 ms