RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ABLIM1O14639 778 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CDCA5Q96FF9 252 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA3CQ99985 751 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 NRCAMQ92823 1304 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT3Q14435 633 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 AAGABQ6PD74 315 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 C12orf29Q8N999 325 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT8Q9NY28 637 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 CYP4F2P78329 520 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4F3Q08477 520 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 UBE2E3Q969T4 207 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 DHRS12A0PJE2 317 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 AZIN1O14977 448 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 MAXP61244 160 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC47A1Q96FL8 570 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 Q96MT0 163 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 PMF1Q6P1K2 205 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-211ENST00000580170 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.43■■□□□ 1.02
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