RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAB3Q8WWW8 586 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 FCRL5Q96RD9 977 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHST12Q9NRB3 414 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBBXA8MT70 800 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 HDAC3O15379 428 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AHSGP02765 367 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 EMP3P54852 163 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP93Q8N1F7 819 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 MOCOSQ96EN8 888 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRGUKQ96M69 825 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACBD6Q9BR61 282 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIK2Q9H0K1 926 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0J9YVX5 310 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANXA9O76027 345 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL6A2P12110 1019 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJB1P25685 340 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AVPR1AP37288 418 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PGGT1BP53609 377 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGP2Q16851 508 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 STYXQ8WUJ0 223 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCYL1Q96KG9 808 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL12RB2Q99665 862 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.46■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDHD2O94830 711 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIGNO95427 931 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAGEA8P43361 318 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLRBP48167 497 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRKAA1Q13131 559 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 POU6F1Q14863 301 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 KYQ8NBH2 561 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 IPMKQ8NFU5 416 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLOD4Q9HC38 313 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACSS2Q9NR19 701 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.45■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 TARM1B6A8C7 271 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 IRAK2O43187 625 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIK3R1P27986 724 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 SERPINB5P36952 375 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCR10P46092 362 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLD2P49005 469 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 BEND5Q7L4P6 421 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 METTL23Q86XA0 190 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 FICDQ9BVA6 458 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PADI3Q9ULW8 664 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEMP1O14524 444 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRID2O43424 1007 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAFKO60675 156 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 VAPBO95292 243 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOXC13P31276 330 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAGLUP54802 743 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPP1Q00013 466 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEPT8Q92599 483 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 PKMYT1Q99640 499 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACOT9Q9Y305 439 aa20.44■□□□□ 0.86
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms