RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 SNX12Q9UMY4 172 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 SLC31A1O15431 190 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-209ENST00000550857 GPR37L1O60883 481 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 HAUS5O94927 633 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRB-209ENST00000550857 FESP07332 822 aa8.1□□□□□ -1.11
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PTPRB-209ENST00000550857 CA14Q9ULX7 337 aa8.09□□□□□ -1.11
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