RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 ARSEP51690 589 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP58Q5T655 872 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM181AQ8N9Y4 354 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM71BQ8TC56 605 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 LMX1AQ8TE12 382 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF599Q96NL3 588 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ITPR1Q14643 2758 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO1FO00160 1098 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 AQP9O43315 295 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 GM2AP17900 193 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CR2P20023 1033 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 THOP1P52888 689 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 YPEL5P62699 121 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 BCL2L1Q07817 233 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 C1orf61Q13536 156 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC14Q15048 493 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 DEFB133Q30KQ1 61 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 KCTD16Q68DU8 428 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ERAP2Q6P179 960 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 MACC1Q6ZN28 852 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJC7Q99615 494 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC61Q9BV99 259 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM208BQ5VWN6 2430 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 NEMP2A6NFY4 417 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 H3BM21 787 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 ALPPL2P10696 532 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 HNF1BP35680 557 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CDH6P55285 790 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 AP1S1P61966 158 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 HS1BP3Q53T59 392 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 PLA2G15Q8NCC3 412 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 CLPBQ9H078 707 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 OR1A2Q9Y585 309 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 TAS2R40P59535 323 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 PTK2BQ14289 1009 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT81Q14533 505 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 INPP5AQ14642 412 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 AGERQ15109 404 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 LIPIQ6XZB0 460 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 MGME1Q9BQP7 344 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 DUSP23Q9BVJ7 150 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 NOD2Q9HC29 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-204ENST00000528201 A8MX80 341 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MFSD11O43934 449 aa24.07■■□□□ 1.44
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PACSIN3-204ENST00000528201 PROSCO94903 275 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PCCBP05166 539 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 GJC1P36383 396 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 RENBPP51606 427 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MAXP61244 160 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 DPYSL3Q14195 570 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF235Q14590 738 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC18A3Q16572 532 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ALG11Q2TAA5 492 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SPASTQ9UBP0 616 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CLCA2Q9UQC9 943 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TOR1BO14657 336 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 OPA1O60313 960 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 MT-CO3P00414 261 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 E2F1Q01094 437 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAF2Q12933 501 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRRQ15256 657 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 GUSBP11Q6P575 273 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 DPPA4Q7L190 304 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 VSTM4Q8IW00 320 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PELI3Q8N2H9 469 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF214Q8ND24 703 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 BTN2A2Q8WVV5 523 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 SPOCK2Q92563 424 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-204ENST00000528201 NUDCD1Q96RS6 583 aa24.06■■□□□ 1.44
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