RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCNIQ14094 377 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KIF22Q14807 665 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NFE2L2Q16236 605 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FXNQ16595 210 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAPKAPK3Q16644 382 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MGAT5BQ3V5L5 792 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRIM61Q5EBN2 209 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF311Q5JNZ3 666 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPIN3Q5JUX0 258 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PAMR1Q6UXH9 720 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MFSD6Q6ZSS7 791 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FRMD7Q6ZUT3 714 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF354CQ86Y25 554 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PASD1Q8IV76 773 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 P3H2Q8IVL5 708 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ODF3L1Q8IXM7 274 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPICE1Q8N0Z3 855 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF786Q8N393 782 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AADATQ8N5Z0 425 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC57Q8N9N7 239 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF610Q8N9Z0 462 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AGAP11Q8TF27 550 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ASB12Q8WXK4 309 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 APPBP2Q92624 585 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IL22RA2Q969J5 263 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGSF8Q969P0 613 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CDCA5Q96FF9 252 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SCLYQ96I15 445 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RAX2Q96IS3 184 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRAC1Q96KF2 57 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TNIP3Q96KP6 325 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 USP28Q96RU2 1077 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CSF3RQ99062 836 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLEC7AQ9BXN2 247 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HOXD1Q9GZZ0 328 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PCDH9Q9HC56 1237 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HCN3Q9P1Z3 774 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 Q9UF83 564 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KCNG1Q9UIX4 513 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TUBD1Q9UJT1 453 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SUFUQ9UMX1 484 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 USP22Q9UPT9 525 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SNX9Q9Y5X1 595 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PSAT1Q9Y617 370 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMCHD1A6NHR9 2005 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GON4LQ3T8J9 2241 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 hDV102S1A0JD36 115 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LCHNA4D1U4 455 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SHISA7A6NL88 538 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RASA4O43374 803 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KDM1AO60341 852 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WDR1O75083 606 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF217O75362 1048 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AP2A2O94973 939 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NXPH2O95156 264 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LYPD3O95274 346 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ITGA2P17301 1181 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ETV5P41161 510 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTPN9P43378 593 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RXRGP48443 463 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ERFP50548 548 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRKAG1P54619 331 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMPRSS3P57727 454 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCT2P78371 535 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMPRSS15P98073 1019 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FCHO2Q0JRZ9 810 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MALLQ13021 153 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SEMA3BQ13214 749 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GAB1Q13480 694 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DNASE1L3Q13609 305 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UBE4AQ14139 1066 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GALNT3Q14435 633 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTPN21Q16825 1174 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GTDC1Q4AE62 458 aa-0.74□□□□□ -2.53
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