RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513344.1

USP45-213, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, human

TSL 3

Gene USP45, Length 801 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP45-213	ENST00000513344	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CUL4B	Q13620	913 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.21	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344		A0A1B0GU03	582 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CAPN9	O14815	690 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	NDUFS7	O75251	213 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SRC	P12931	536 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.2	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	STX16	O14662	325 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ANP32C	O43423	234 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	FGF5	P12034	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CDH1	P12830	882 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SRD5A1	P18405	259 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SERPINB3	P29508	390 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	MCM2	P49736	904 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	NEDD9	Q14511	834 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	EFNB3	Q15768	340 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.19	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	EBAG9	O00559	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	DVL1	O14640	695 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CEP104	O60308	925 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	NDUFB4	O95168	129 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	RXRA	P19793	462 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	BLMH	Q13867	455 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	RND1	Q92730	232 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	RNF224	P0DH78	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.17	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344		A0A1W2PS18	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
USP45-213	ENST00000513344	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74

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