RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP9	Q9H5L6	903 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.02	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511		E5RJQ4	531 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ERQ8	282 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511		M0QYT0	321 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	AGRP	O00253	132 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SUV39H1	O43463	412 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	MED7	O43513	233 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LEFTY1	O75610	366 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCY5	O95622	1261 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRB3	P13945	408 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GPD2	P43304	727 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FMO5	P49326	533 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA8	P51970	172 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH4	P55283	916 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	MTA1	Q13330	715 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TGIF1	Q15583	401 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RBFA	Q8N0V3	343 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KAT5	Q92993	513 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG14	Q96F25	216 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PISD	Q9UG56	409 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD51B	O15315	384 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP12	O43422	761 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GALT4	O96024	378 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPC	P11150	499 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HGF	P14210	728 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A5	P35504	534 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	IRAK1	P51617	712 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TLE1	Q04724	770 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF5	Q15542	800 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FDX2	Q6P4F2	183 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLON5	A6NGN9	336 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PAGE1	O75459	146 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAP2	O75791	330 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB7	P26010	798 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	L1CAM	P32004	1257 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FGL2	Q14314	439 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEA2	Q15560	299 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC31	Q6UY01	552 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	VASH2	Q86V25	355 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC61	Q9BV99	259 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		11	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11	□□□□□ -0.65

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