RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 TAS2R38P59533 333 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TPI1P60174 286 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CARD16Q5EG05 197 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HGSNATQ68CP4 663 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NEK5Q6P3R8 708 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS36Q86VN1 386 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM69Q86WT6 500 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARRDC3Q96B67 414 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SGF29Q96ES7 293 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SERAC1Q96JX3 654 aa6.52□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HDAC8Q9BY41 377 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.52□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 THSD1Q9NS62 852 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DONSONQ9NYP3 566 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DMTF1Q9Y222 760 aa6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.52□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 RASA4O43374 803 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 BUB1O43683 1085 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PRPSAP2O60256 369 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 TMCC1O94876 653 aa6.51□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 GYPCP04921 128 aa6.51□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 ITGB7P26010 798 aa6.51□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DCTP40126 519 aa6.51□□□□□ -1.37
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CTDSPL-208ENST00000486978 NEK3P51956 506 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 NXPH1P58417 271 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 E2F1Q01094 437 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CA9Q16790 459 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ISXQ2M1V0 245 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PARP15Q460N3 678 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 USP53Q70EK8 1073 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 VASH2Q86V25 355 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 MIB2Q96AX9 1013 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HMCESQ96FZ2 354 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PEBP4Q96S96 227 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM7Q9C029 511 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 KLC2Q9H0B6 622 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 TSPY26PQ9H489 355 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GDF3Q9NR23 364 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CTDSPL-208ENST00000486978 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.51□□□□□ -1.37
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