RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 DPP6P42658 865 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 INHBCP55103 352 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 AGKQ53H12 422 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 AHI1Q8N157 1196 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 HASPINQ8TF76 798 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 NAT14Q8WUY8 206 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM209Q96SK2 561 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 OLFM1Q99784 485 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 NT5MQ9NPB1 228 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 OSER1Q9NX31 292 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 VWA7Q9Y334 891 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TNFRSF10BO14763 440 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 RHOQP17081 205 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 STX1BP61266 288 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PRAMEP78395 509 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 LAMB3Q13751 1172 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 GNASQ5JWF2 1037 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MARC1Q5VT66 337 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 REP15Q6BDI9 236 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SUSD3Q96L08 255 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PKP2Q99959 881 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SP110Q9HB58 689 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 A0A1W2PQH9 124 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 AURKAO14965 403 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CLPTM1O96005 669 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 IMPDH1P20839 514 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CD86P42081 329 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ATP4BP51164 291 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MAP7Q14244 749 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 FAM45BPQ6NSW5 357 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SCD5Q86SK9 330 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 C14orf80Q86SX3 495 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SERINC5Q86VE9 423 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 FAM45AQ8TCE6 357 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CNBD2Q96M20 576 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SARDHQ9UL12 918 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 H0YJX3 145 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CAPNS1P04632 268 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 C8BP07358 591 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 GRIA2P42262 883 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MGAT3Q09327 533 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MON1AQ86VX9 555 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 LILRA2Q8N149 483 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PHF21BQ96EK2 531 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ASB2Q96Q27 587 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PADI3Q9ULW8 664 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 AP4S1Q9Y587 144 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 A0A0U1RQF3 1178 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MRASO14807 208 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SMIM18P0DKX4 95 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 CD52P31358 61 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 TBX4P57082 545 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 LRP8Q14114 963 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf3-218ENST00000482056 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms