RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 JUNDP17535 347 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ACP1P24666 158 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LIG3P49916 1009 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 SCNN1BP51168 640 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ADKP55263 362 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IL10RBQ08334 325 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IRF4Q15306 451 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 BOLA3Q53S33 107 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TMPRSS12Q86WS5 348 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CCDC170Q8IYT3 715 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LMX1AQ8TE12 382 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 A0A0U1RQS6 177 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 H3BRJ5 948 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 MAFKO60675 156 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 C6P13671 934 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 XPAP23025 273 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CSNK1DP48730 415 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 GSDMDP57764 484 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 DAB2P98082 770 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 RALGDSQ12967 914 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LBRQ14739 615 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ACAP1Q15027 740 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PARGQ86W56 976 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PELI3Q8N2H9 469 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TC2NQ8N9U0 490 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IFT43Q96FT9 208 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CLPBQ9H078 707 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 DONSONQ9NYP3 566 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IP6K2Q9UHH9 426 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 INTUQ9ULD6 942 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa13.11□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 MAP3K6O95382 1288 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 H2AFZP0C0S5 128 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CKMT1AP12532 417 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 GM2AP17900 193 aa13.1□□□□□ -0.31
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HPS1-211ENST00000478087 MMP12P39900 470 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ARL4AP40617 200 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ARSEP51690 589 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 THOP1P52888 689 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CDH6P55285 790 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TAS2R40P59535 323 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 MAXP61244 160 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IHHQ14623 411 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 INPP5AQ14642 412 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LRRC14Q15048 493 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CDKN3Q16667 212 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TMCO3Q6UWJ1 677 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 H2AFVQ71UI9 128 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TMTC1Q8IUR5 882 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 SMIM14Q96QK8 99 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PSKH2Q96QS6 385 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CHP1Q99653 195 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 OR1A2Q9Y585 309 aa13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CPED1A4D0V7 1026 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 NEMP2A6NFY4 417 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 MYO1FO00160 1098 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 AQP9O43315 295 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 PCCBP05166 539 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 CR2P20023 1033 aa13.09□□□□□ -0.31
HPS1-211ENST00000478087 FECHP22830 423 aa13.09□□□□□ -0.31
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