RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 MTBPQ96DY7 904 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SGSM3Q96HU1 749 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GCNAQ96QF7 691 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 UCN2Q96RP3 112 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CERS4Q9HA82 394 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TDP1Q9NUW8 608 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 MKS1Q9NXB0 559 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 DPP7Q9UHL4 492 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 FBXO10Q9UK96 956 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GMNCA6NCL1 334 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 H0Y626 953 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CBX4O00257 560 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF197O14709 1029 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 INSIG1O15503 277 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SPAG7O75391 227 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 KRT37O76014 449 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TMCC1O94876 653 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 PRKCGP05129 697 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ALADP13716 330 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 KRT15P19012 456 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 HLA-DPA1P20036 260 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 DRD4P21917 467 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CNTFP26441 200 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 HLA-FP30511 346 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 FOXN2P32314 431 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CSNK1DP48730 415 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SLC12A1Q13621 1099 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF235Q14590 738 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 POU6F1Q14863 301 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GRTP1Q5TC63 336 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 LINGO4Q6UY18 593 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 DDI1Q8WTU0 396 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 PEX13Q92968 403 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ACDQ96AP0 544 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 AGAP2Q99490 1192 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RBBP8Q99708 897 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CPNE1Q99829 537 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TLE6Q9H808 572 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.74□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 HEATR9A2RTY3 570 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 K7ERQ8 282 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 KRT38O76015 456 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 NDST3O95803 873 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GLP2RO95838 553 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GSRP00390 522 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 MT-ND3P03897 115 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 FGF1P05230 155 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ITGA2BP08514 1039 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 SERPINF2P08697 491 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 BMP8BP34820 402 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 AVPR1AP37288 418 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GP5P40197 560 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 NRIP1P48552 1158 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 NUMBP49757 651 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ITKQ08881 620 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TRAF2Q12933 501 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 BMPR2Q13873 1038 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RAB30Q15771 203 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CNGA3Q16281 694 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 PCSK7Q16549 785 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 GAB4Q2WGN9 574 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 LGSNQ5TDP6 509 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 KCNMB4Q86W47 210 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 MFN1Q8IWA4 741 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA6-210ENST00000475302 CNPY4Q8N129 248 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms