RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461827.5

APOBEC3G-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3G, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-202ENST00000461827 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 GAGE10A6NGK3 116 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF185O15231 689 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 ELANEP08246 267 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 WEE2P0C1S8 567 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 RCAN1P53805 252 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 KRT83P78385 493 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 TSPY1Q01534 308 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 SEMA3BQ13214 749 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 GRM7Q14831 915 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 TAF11Q15544 211 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 MLANAQ16655 118 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 GLG1Q92896 1179 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 RNFT2Q96EX2 444 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 NPAS1Q99742 590 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 MRGBPQ9NV56 204 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF711Q9Y462 761 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.65□□□□□ -1.34
APOBEC3G-202ENST00000461827 NFASCO94856 1347 aa6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 MCM3APO60318 1980 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 A0A1W2PQM1 296 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 PTGES3LE9PB15 166 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 F5H697 171 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 HBP1O60381 514 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 MFAP3LO75121 409 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 BEST1O76090 585 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 CHRNA1P02708 482 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TMEM225BP0DP42 221 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 KCNA5P22460 613 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 UBA7P41226 1012 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 GPD2P43304 727 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 MESP2Q0VG99 397 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 CHAF1BQ13112 559 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 PSMD6Q15008 389 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 LY9Q9HBG7 655 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 DCXO43602 365 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TSPAN9O75954 239 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 GPANK1O95872 356 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 URODP06132 367 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TNNT1P13805 278 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 PRKCHP24723 683 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 BSGP35613 385 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 CDH15P55291 814 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 MGAT3Q09327 533 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 EPS8Q12929 822 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TUBB3Q13509 450 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 RASA2Q15283 850 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TCTN1Q2MV58 587 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 HTR3DQ70Z44 454 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3G-202ENST00000461827 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms