RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	EBF2	Q9HAK2	575 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PR77	199 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	FZD6	O60353	706 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PGLS	O95336	258 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CER1	O95813	267 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CP	P00450	1065 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF883	P0CG24	379 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ENG	P17813	658 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN3	P26045	913 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB17	Q13105	803 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DPPA4	Q7L190	304 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CNTD1	Q8N815	330 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ACTL9	Q8TC94	416 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TCEAL3	Q969E4	200 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TEKT5	Q96M29	485 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD11	O00231	422 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TM7SF2	O76062	418 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	C21orf59	P57076	290 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DSC2	Q02487	901 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TRAF2	Q12933	501 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	GRIK2	Q13002	908 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SLC14A1	Q13336	389 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	STAT4	Q14765	748 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	USP45	Q70EL2	814 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	OXR1	Q8N573	874 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PAF1	Q8N7H5	531 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TADA1	Q96BN2	335 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SCRN2	Q96FV2	425 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP54	Q96N23	3096 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	IGLON5	A6NGN9	336 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241		H7C0C1	242 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SLC30A4	O14863	429 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	YKT6	O15498	198 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	GJB3	O75712	270 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5O	P48047	213 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	WASHC5	Q12768	1159 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	LLGL1	Q15334	1064 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	STPG1	Q5TH74	334 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A18	Q96N87	628 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	RTKN	Q9BST9	563 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	GLOD4	Q9HC38	313 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ITM2B	Q9Y287	266 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PTPA-222	ENST00000445241	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		14.71	□□□□□ -0.05

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