RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA6P08133 673 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 ERCC2P18074 760 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 HTR1BP28222 390 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINA4P29622 427 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 HK3P52790 923 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 GABREP78334 506 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 FAXCQ5TGI0 409 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35F3Q8IY50 421 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM11Q96F44 468 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD36A6QL64 1941 aa21.14■□□□□ 0.98
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GTH6 734 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 CPED1A4D0V7 1026 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 YY2O15391 372 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 DAPK3O43293 454 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PRPSAP2O60256 369 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 LRCH4O75427 683 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PALMO75781 387 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MPOP05164 745 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ALPIP09923 528 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MYBL1P10243 752 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TSHRP16473 764 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MIPP30301 263 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 RGRP47804 291 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 LIG3P49916 1009 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TLE3Q04726 772 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 IL10RBQ08334 325 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MTM1Q13496 603 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 NFATC4Q14934 902 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ELOCQ15369 112 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 SRLQ86TD4 932 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM9Q86XI8 627 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 LZTR1Q8N653 840 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ATL2Q8NHH9 583 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 SPOCK2Q92563 424 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 SP110Q9HB58 689 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.14■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TK2O00142 265 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 RASGRP1O95267 797 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PCK1P35558 622 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf61Q13536 156 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 DPYSQ14117 519 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ALG11Q2TAA5 492 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 FIGNQ5HY92 759 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 NPWQ8N729 165 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ARL10Q8N8L6 244 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF599Q96NL3 588 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PSKH2Q96QS6 385 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 APOOQ9BUR5 198 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM7Q9C029 511 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.13■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.973e-8■■□□□ 12.2
LIMS1-208ENST00000428064 AP1S1P61966 158 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 RALGDSQ12967 914 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 INPP5AQ14642 412 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PERM1Q5SV97 790 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF653Q96CK0 615 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 LGMNQ99538 433 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ISCUQ9H1K1 167 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ZWILCHQ9H900 591 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 THSD1Q9NS62 852 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MUSKO15146 869 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 RENBPP51606 427 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 BCL2L1Q07817 233 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 DPYSL2Q16555 572 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 WDR92Q96MX6 357 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT3Q9UH03 358 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 PADI4Q9UM07 663 aa21.11■□□□□ 0.97
LIMS1-208ENST00000428064 DGKBQ9Y6T7 804 aa21.11■□□□□ 0.97
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