RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB26Q9ULW5 256 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRN2-201ENST00000389413 DYTNA2CJ06 578 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TYROBPO43914 113 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PEX6Q13608 980 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 AGAP2Q99490 1192 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 APOL4Q9BPW4 351 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ALS2Q96Q42 1657 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PEX2P28328 305 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SCNN1AP37088 669 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 UBR7Q8N806 425 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 STRA6Q9BX79 667 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ETAA1Q9NY74 926 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MYH3P11055 1940 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A0J9YYE9 177 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 CD52P31358 61 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 HTR7P34969 479 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DAOAP59103 153 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SVOPQ8N4V2 548 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 LGR5O75473 907 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ATG7O95352 703 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 OR56A5P0C7T3 313 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 RRM2P31350 389 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TUSC3Q13454 348 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TEKT5Q96M29 485 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DMTF1Q9Y222 760 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 TREHO43280 583 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 C4AP0C0L4 1744 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 C4BP0C0L5 1744 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ABL2P42684 1182 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 CNTN1Q12860 1018 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 GALNT3Q14435 633 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DDR2Q16832 855 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ARL15Q9NXU5 204 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MAP3K13O43283 966 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM20BO75063 409 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PGK1P00558 417 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP1A4Q13733 1029 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM187BQ17R55 369 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM228AQ86W67 206 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SFRP1Q8N474 314 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 C19orf60Q96EN9 201 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PCED1BQ96HM7 432 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DLGAP3O95886 979 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 IGSF6O95976 241 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 PCNAP12004 261 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 RAP1GDS1P52306 607 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 MAPK10P53779 464 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DLG2Q15700 870 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 CRY1Q16526 586 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRN2-201ENST00000389413 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms