RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 METP08581 1390 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYO16Q9Y6X6 1858 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HRKO00198 91 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TXNDC9O14530 226 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UNC5CO95185 931 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ASGR1P07306 291 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CSF1RP07333 972 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYBL1P10243 752 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KELP23276 732 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPA1P27694 616 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CPOXP36551 454 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 METAP1P53582 386 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HUNKP57058 714 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC29A2Q14542 456 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AARDQ4LEZ3 155 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RUFY3Q7L099 469 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC3L1Q86VI1 746 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP18Q8N392 663 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB40AQ8WXH6 277 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A28Q96A46 364 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HIST1H2AJQ99878 128 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ECT2Q9H8V3 914 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TUFT1Q9NNX1 390 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRPV5Q9NQA5 729 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHRAC1Q9NRG0 131 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OLAHQ9NV23 265 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UCKL1Q9NWZ5 548 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF24Q5T7B8 1368 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM131Q92545 1883 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PPE2 198 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PR64 198 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AQP7P3A6NL99 342 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BTBD18B2RXH4 712 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRIT1O00522 736 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB43O43298 467 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LIASO43766 372 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GUCY1B2O75343 617 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CXCL14O95715 111 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BRCC3P46736 316 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PSMD7P51665 324 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RTP1P59025 263 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GMFBP60983 142 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BEX3Q00994 111 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNJ12Q14500 433 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPA17Q15506 151 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNFT1Q5M7Z0 435 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CPLX4Q7Z7G2 160 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF18AQ8NI77 898 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RNF139Q8WU17 664 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SCAMP4Q969E2 229 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VPS39Q96JC1 886 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IFT74Q96LB3 600 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SYNPO2LQ9H987 977 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MPP6Q9NZW5 540 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TEKT2Q9UIF3 430 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FBXL5Q9UKA1 691 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYLKQ15746 1914 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLRN2A0PK11 232 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TO15178 435 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 USP12O75317 370 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MOSPD3O75425 235 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHEK2O96017 543 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GJC1P36383 396 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCR10P46092 362 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ASMTP46597 345 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CAMLGP49069 296 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HARS2P49590 506 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DGKEP52429 567 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SHBQ15464 509 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SGCBQ16585 318 aa2.56□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MAJINQ3KP22 176 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms